Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTLA4P16410 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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