Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms