Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms