Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRNB1P11230 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms