Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPRFP10586 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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