Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYBBP04839 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms