Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EDIL3O43854 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms