Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KDELR3O43731 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KDELR3O43731 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KDELR3O43731 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms