Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HOXA3O43365 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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