Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

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Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ZNF208O43345 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ZNF208O43345 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ZNF208O43345 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ZNF208O43345 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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ZNF208O43345 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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ZNF208O43345 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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