Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AURKAO14965 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AURKAO14965 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AURKAO14965 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AURKAO14965 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AURKAO14965 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AURKAO14965 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AURKAO14965 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AURKAO14965 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AURKAO14965 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AURKAO14965 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AURKAO14965 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1378.6 ms