Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR3AO14802 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms