Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EBAG9O00559 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms