Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PCH4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E9PCH4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E9PCH4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E9PCH4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
E9PCH4 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
E9PCH4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PCH4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E9PCH4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms