Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
C9orf172C9J069 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms