Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARID3CA6NKF2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms