Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRRD1A4D1F6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms