Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms