Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
DSEQ9UL01 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSEQ9UL01 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSEQ9UL01 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSEQ9UL01 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSEQ9UL01 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSEQ9UL01 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSEQ9UL01 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DSEQ9UL01 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms