Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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HOXC10Q9NYD6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC10Q9NYD6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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HOXC10Q9NYD6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC10Q9NYD6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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