Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms