Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SNX15Q9NRS6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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