Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYP4F12Q9HCS2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms