Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPR88Q9GZN0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GPR88Q9GZN0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms