Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
BHLHE41Q9C0J9 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms