Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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