Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms