Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms