Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms