Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SGCZQ96LD1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms