Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RNF128Q8TEB7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms