Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBA3Q8TBC4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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