Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC117Q8IWD4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms