Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKL3Q8IVW4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms