Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXD4L3Q6VB84 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXD4L3Q6VB84 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms