Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRAMD4Q6IC98 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms