Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms