Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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