Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms