Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RAB6CQ53S08 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RAB6CQ53S08 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RAB6CQ53S08 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB6CQ53S08 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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