Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms