Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYF9

KRTAP19-7, Keratin-associated protein 19-7, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP19-7Q3SYF9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
KRTAP19-7Q3SYF9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms