Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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GEN1Q17RS7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GEN1Q17RS7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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