Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FSCN1Q16658 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms