Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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ECM1Q16610 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ECM1Q16610 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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ECM1Q16610 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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