Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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