Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SIX1Q15475 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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