Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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