Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TRAM2Q15035 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms