Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
RAB39AQ14964 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
RAB39AQ14964 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms